Marques Carrilho, J. M. (2015) Estéticas da Informática Musical : A Energia Musical Irrealizada. Tese de Doutoramento apresentada à Universidade Católica Portuguesa, para obtenção do grau de doutor em Ciência e Tecnologia das Artes, especialização em Informática Musical. Orientador: António de Sousa Dias. Classificação: Magna cum Laude

Marques Carrilho,  J. M  (2016). Sound at the edge of consciousness: biomusicology and quantum biology. Animalia Vegetalia Mineralia. Revista de Ecomedia e estudos Ecocríticos. ISSN 2183-265X

Marques Carrilho,  J. M  (2015). Zoomusicology: The wisdom of living sound(5 artigos). Animalia Vegetalia Mineralia. Revista de Ecomedia e estudos Ecocríticos. ISSN 2183-265X

Marques Carrilho,  J. M  (2015). Zoomusicology: Sound as a vibration of life. Animalia Vegetalia Mineralia. Revista de Ecomedia e estudos Ecocríticos. ISSN 2183-265X

Marques Carrilho, J.M. (2013) Paradoxologia Musicográfica Futura(no prelo)

Marques Carrilho, J. M. (2013). Jonas Runa Cosmic Ensemble. Aesthetics of Music Informatics: Unrealized Musical Energy

Marques Carrilho, J.M. (2013). Solo with Robot Orchestra. Aesthetics of Music Informatics: Unrealized Musical Energy

Marques, Carrilho, J.M., Lima Barreto, J. (2011). Zul Zelub e a Energia Musical Irrelizada. Revista Triplov. Organização: António Barros.

Marques Carrilho, J. M. (2009). Musica Electronica Documenta. Açores: Atlantida - Revista de Cultura. (Artigo)

Marques Carrilho, J.M. (2008) Eletronika Triptikum. Tese de Licenciatura em Sonologia: Composição, Performance e Investigação em Música Eletrónica, apresentada ao Instituto de Sonologia, Conservatório Real de Haia, Holanda. Orientador: Konrad Boehmer. Co-orientador: Peter Pabon.

Marques Carrilho, J. M.  (2007). Música e Filosofia no Tempo de Avicenna. Açores: Atlântida - Revista de Cultura. (Artigo)